我自己很少把'雖然'兩字獨立成句，意思相近的 '儘管' 也很少獨立成句。
你舉的文言例子，我覺得跟白話中的雖然一詞已經有點差異了
如果要翻成白話，應該接近 '即使如此' 那麼這樣的意思獨立成句比較自然一點
我倒是有個假說

確實。文言中那種用法與白話已經不同了。也就是文言中「雖然」必得肯定某個前文，之後「即使如此」白話中卻相反，是「雖然」帶出某個待轉折的後文。不過我查了一下，英語中 although 僅作 conj，不作 adv似乎地位與 however、nevertheless 異。感覺上白話的「雖然」更像是 although，後方必接子句為是。所以我前文說白話「雖然」副詞，是我錯了，更像連詞。總之「雖然+，」果然是奇怪的表達方式。不只我這麼認為！^^猜測這種把「雖然」獨立成句或許還是生吞古文的後果吧？

咦 我從小學就習慣"雖然"及"但是"加逗號再寫下半句耶

主要是口語化語氣的差別,加逗號,加重"雖然"的口音

啊，是嗎？但除非很特別的情況，否則語氣斷了還是怪啊？