※ 引述《leebiggtest (小魯不要醃黃瓜)》之銘言：
日本很多這種難讀地名或站名
有時候可能是像北海道的愛努語（Ex. 稚内→冰冷的河川）
或是沖繩的原有地名（Ex. 東江→あがりえ）
當然不只有後期日本得到的這些領土
像傳說故事、民間傳說或文化傳統等等都會影響地名念法
而且不只關西，關東也是非常多，舉幾個例子：
千葉県酒々井町→しすい（傳說故事）
茨城県女化町→おなばけ（民間傳說）
東京都牟礼町→むれ（1.古韓文 2.當地文化傳統→群聚之意）
關西也就更多了，像是：
大阪府城東区放出→はなてん（1.地理位置 2.當地傳說）
和歌山県和歌山市布施屋→ほしや（當地特殊念法）
大阪府東大阪市御厨→みくりや（歷史緣故）
如果這要寫論文是可以寫很長一串的，
所以容我在這裡只舉幾個簡單的小例子就好XD。
如果要談到更細的話，推薦去看這幾套書：
角川日本地名大辞典／角川書店, 1992
日本歴史地名大系／平凡社, 1974
大日本地名辞書／吉田東伍, 富山房, 1900（2003新裝）
大日本地名這本因為是1900年出版，
內容也有寫到當時的台灣、蝦夷跟樺太地區，
但是書中的地名不論是國內或現今非日本國土，
差異性還是會比上面那兩本大。
如果真的不想讀書的話，也可以Google：
1) 日本難読地名
2) 日本難読駅名
3) 找尋各地區的Website／各地區傳說故事
相信這些資料可以解答原PO的疑惑，
因為我也只是一個普通的學生XD，
在各位前輩面前野人獻曝一下，若有錯誤歡迎指正，謝謝！