指 揮 官 陳 時 中 衛生福利部部長
副指揮官 陳 宗 彥 內政部次長
發 言 人 莊 人 祥 疾管署副署長
專家諮詢小組
召集人 張上淳 台大副校長兼台北區網指揮官
醫療應變組
組 長 薛瑞元 衛生福利部次長
副組長 王必勝 醫福會執行長
副組長 羅一鈞 疾管署副署長
副組長 石崇良 醫事司長
副組長 李伯璋 健保署署長
疫情監測組
組 長 周志浩 疾管署署長
副組長 谷瑞生 外交部研究設計委員會主任
副組長 劉定萍 疾管署疫情中心主任
邊境檢疫組
組 長 陳宗彥 內政部次長
副組長 鍾景琨 移民署副署長
副組長 何麗莉 疾管署檢疫組長
副組長 蔡志儒 陸委會法政處長
社區防疫組
組 長 何啟功 衛生福利部政務次長
副組長 莊人祥 疾管署副署長
副組長 王英偉 國健署署長
副組長 林清淇 內政部民政司長
物資組
組 長 王美花 經濟部政務次長
副組長 陳佩利 經濟部工業局主秘
副組長 蔡壽洤 衛福部秘書處長
資訊組
組 長 簡宏偉 行政院資安處處長
副組長 龐一鳴 衛福部資訊處處長
研發組
組 長 梁賡義 國衛院院長
副組長 吳秀梅 食藥署署長
副組長 某個中央研究院代表
行政組
組 長 鄭舜平 衛福部主秘
副組長 鄧如秀 疾管署主秘
新聞宣導組
組 長 高 遵 行政院新傳處長
副組長 曹凱玲 疾管署公關室主任
法務組*
組 長 陳明堂 法務部次長
副組長 鍾瑞蘭 法務部法律事務司司長
*法務組4/14增設，4/17網友大大來信更正名單
( 所以猜測副組長跟著搬移 )