「半薪免稅」救火，能堵住逃亡潮？醫師繳稅不為人知的2個祕密
更新日期 ／ 2025-06-16
．文 ／ 邱宜君
．責任編輯 ／ 連珮妤
．出處 ／ 康健編輯部
．圖片來源 ／ Shutterstock
https://www.commonhealth.com.tw/article/92811
為挽回醫院人力，健保署提出「半薪免稅」，醫界多叫好。但你可能不知道，醫師繳稅的
稅額也有「階級」之分。
健保署日前一場會議，將影響全台灣大約3萬5千名醫院醫師的實質收入，最快明年報稅時
，醫院醫師的「加班費」就可免稅，免稅比率可能達到半薪，藉以搶救人才。
健保署此舉意在打破公私醫院間現行潛規則，以及診所與醫院間的稅務差異。根據《康健
》記者調查，許多私立醫院早已將醫師薪資部分比率列為「免稅加班費」，公立醫院卻相
對保守，形成公私立醫院間落差，資薪幅度愈差愈遠。
另一方面是診所報稅的減免空間較醫院大，造成醫院人才不斷流失，社區醫院協會榮譽理
事長謝文輝不諱言，開業醫收入先扣除很大比率的「成本」才課稅，實質收入是醫院受雇
醫的數倍，生活品質又好，更讓醫院醫師萌生辭意。
醫院醫師半數工時可報免稅加班
根據當天會議結論，當主治醫師或住院醫師每日工作超過8小時、每週超過40小時，或休
假日出來工作，就算延長工時，這些工時相對應的加班費，要適用《所得稅法》的加班費
免稅規定。至於加班時數的上限，一般勞工是每月46小時，醫師則是採取每月總工時的
50%為上限。
健保署署長石崇良表示，醫院醫師工時長，許多科都需要待命或隨傳隨到，卻沒有免稅規
定，不符合稅務公平，所以才會開會討論哪些工作算加班、加班標準是什麼，以研議新做
法。
他舉例說，未來如果一位醫師每週總工時是80小時，當中最多有40小時可以是加班時數，
這40小時的收入可免稅。上述結論的執行，可由衛福部以函釋方式通案處理，或由健保署
修訂「全民健康保險醫事服務機構特約及管理辦法」，需再進行跨部會討論。
石崇良強調，現在最多只能算46小時加班免稅，對超長工時的醫師並不公平。若明定免稅
加班時數上限為總工時的50%，公私立醫院都適用會比較公平，也可藉此留住醫師在大醫
院。
現行公私立醫院做法大不同
健保署大費周章開會討論，檯面上沒說的是現行醫師收入已有加班費免稅。一名私立醫院
主治醫師F表示，很多私立醫院的醫師薪資，都有一定比率被列為「加班費」，由醫院上
報國稅局，醫師這筆收入就免稅，有些薪資單甚至列出「免稅加班費」這一項，金額將近
是當月薪資的4分之1。
但醫師並不適用《勞基法》，正常工時和延長工時都沒有定義，加班費也沒有計算依據，
醫院怎麼報加班費？連不用加班的科別也有免稅加班費？「醫院敢報，不要太離譜，國稅
局只能相信，」F說。
私立醫院的做法，造成公立醫院在召聘醫師時更弱勢。台北市醫師職業工會祕書長陳亮甫
表示，公立醫院的人事或會計通常是公務員，如果醫師沒加班卻報免稅，可能涉圖利罪遭
重罰，所以大多數公立醫院都不想報或是報的極少，曾有工會會員醫師親臨國稅局舉證，
才爭取到退稅。
反觀私立醫院，大部分都有為醫師報免稅加班費，且各院、各科免稅額度的高低不同，早
已是醫師口耳相傳、比較待遇的重點之一。
診所醫師免稅空間比醫院醫師大
另一項棘手的問題是，診所執業醫師的免稅空間比醫院受雇醫師更大。一位不願具名的資
深會計師L表示，診所若有找會計人員製作帳簿文據，可採「實質課稅」，根據「實際收
入」扣除「實際成本費用」後的所得金額，去申報所得稅。然而，很多開業醫師工作繁忙
沒空記帳，或為節省成本而沒有請會計，結果無帳可查。
國稅局人力有限，為了簡政便民又能課到稅，針對無帳可查的診所便採取「推計課稅」。
L會計師表示，診所主要收入來源包括健保、自費，健保收入容易掌握，自費收入仰賴誠
實申報，國稅局會依據診所逐一記載舉證的成本及收入相關資料，去推計應申報的營業所
得。
「法理上有選擇性的時候，就會產生稅賦差，」L會計師表示，法規只規定有實質課稅，
推計課稅是不得已的辦法，卻讓醫師有了選擇性，創造出稅賦差。若要解決推計課稅的稅
賦差、杜絕逃漏稅，國稅局人力恐怕加增10倍都不一定夠。
100家醫院有超過100種算法，做到3件事才能合法免稅
既然診所問題難以解決，健保署只好回到醫院裡開創免稅空間。但到底醫師的加班時數和
加班費該怎麼算才合理？
以醫師工作的特殊性，仍有許多問題待解。「醫師的薪水不是按照工時算的，」F醫師舉
例說，A醫師值班一晚，開了一台給付很甜的刀，B醫師值班一晚，都沒病人，如果值班等
於加班，他們加班時數都一樣，為醫院創造的收益不同，所以A、B醫師這一晚的酬勞絕對
不同，加班酬勞與加班時數關係不大。更何況可能有醫院藉此漏洞，直接將醫師一半收入
列為免稅加班費，藉以逃漏稅。
資深會計師L分析，醫師是高薪資所得的職業，要求比照一般勞工的加班時數免稅規定，
可能引發負面社會觀感；醫師加班費算法也比一般勞工複雜得多，100家醫院的加班費算
法可能超過100種。
若要以理服人，最重要的是建立一致性。L會計師表示，每週、每月、每年，都要有一致
的標準去計算工時，也不能因人而異。這套標準必須公開、透明，而且經勞雇雙方同意，
任何人去驗算，都算出一樣的結果，這就是一致性。
其次是醫院必須提供國稅局完整的工時紀錄。如果行政教學研究算工時，都要記錄下來；
沒有固定打卡時間的責任制，也要確實記錄時間。
第三是加班必要性的證明。一般勞工的加班費，必須有主管提出工作需求，確實有延長工
時的必要，才能算加班。誠實提供醫師工時紀錄、加班必要性的證明，才能滿足免稅所需
的財稅規定。
工時基礎非常重要，L會計師強調，因為現行法規的「加班免稅」，其實是「工時」免稅
，不是「工資」免稅。也就是說要先有加班的事實，才用公開透明的標準將工時換算為加
班費免稅額，而不是希望有多少工資免稅，就把這一塊切出來說是加班費。
出身急診的健保署署長石崇良憂心忡忡，他說明將推動3措施、3計劃改善急診壅塞，也對
全台醫師提出懇求，對院方提出呼籲，立即閱讀〈急診快崩盤！健保署3計劃搶救，「請
再給我們一點時間」石崇良親上火線懇求〉
收入只是原因之一！2關鍵才是止住醫院人力流失的特效藥
雖然還有許多問題須解決，但醫界普遍樂觀其成，期盼是一劑能止血醫院人力流失的特效
藥。
台灣醫務管理學會理事長洪子仁表示，長期醫療人才流失嚴重，醫院設法提高薪資，政府
也給予免稅鼓勵，雙管齊下，都是為了提高留任誘因，讓醫院執業環境變好。醫學中心協
會理事長陳建宗也說，希望這能達到鼓勵作用，讓所有醫師更願意留在自己的崗位上。
然而，台灣醫療改革基金會執行長林雅惠提醒，「收入只是讓醫師離開醫院的眾多原因之
一。」近期醫院離職潮當中，已有急診醫師發出「這種工作環境，錢再多我也不要做了」
的不平之鳴，這顯示，唯有有效保障等薪酬待遇和勞動權益，才是更根本的留才之道。
這篇文相當長
簡言之就是在談醫院醫師報稅之探討
最近真的是文章連發
不知道有沒有用?

改這種皮毛有什麼用？自請下台吧

醫生會繳這麼多稅就是多虧一樓的偶像楊志良先生啊公立醫院也是可以值班費免稅的，只是只要醫生沒去吵，行政人員就是裝死當作不知道

下班時間做晨會報告算工時嗎

稅雖然有差 但不是醫院醫心死離開的主要原因吧

康健有什麼政治能量我是不相信啦==

唉民進黨只會搞這種小手段 還是我們壯壯們最愛的楊志良才可以拯救世人

石崇 楊志 超級讚

不是沒吵過喔 吵了跟你說其他人都沒這樣做 沒有一個依據他們沒辦法

笑死~~ 還想騙?? 誰有拿過加班費?

這個錢還是被醫院拿走吧

內文提到國稅局增十倍人力都不一定夠查醫院診所謊報、逃漏稅，是不是故意做球給健保署接？以後除了「A健保」外，又多了「醫師集體逃稅」這個操縱輿論打壓不聽話醫師的工具了

沒關係吧？就繼續離職，讓醫院繼續崩

說個笑話 公立醫院的會計跟計算方法

問題是醫院的外科醫生隨便都週工時>100

當住院醫師這麼多年，週工時一百小時也沒看過什麼鬼加班費

笑死？騙40%？？？！

不用太期待現在的政府喇，民進黨朋友都說缺乏幕僚到政務官沒什麼心力做出什麼有遠見的思考ㄌ，蘇院長那時候至少一堆自己子弟兵幕僚充足，現在滿朝左膠，我是覺得不需要有太高期待喇嘻嘻，醫護崩潰說不定最後要說大罷免完就能解決了，對吧^_^邱宜君記者跑去康健，那聯合之後會都剩下北頂好業配嗎嘻嘻

診所很多受僱的不用繳稅吧，徵人直接說稅務診所處理

公立醫院的會計就是行政怠惰啊，盧到他們受不了他們就會處理了，而且實際上醫院沒損失

請不要質疑你的大腦袋官員

超過8小時就算延長工時？ 要確餒 現在是10小時 禮拜六還要做白工

值班不是加班 一句話就壓死

敝院人事就這樣認定...寫在班表上就不算加班

主治醫師責任制，哪有加班費！公立醫院值班一天幾百塊而已

用這個方案是真的把醫生當猴子了

笑死? who cars? 綠蛆嗎? 問党啊!

先從衛福部醫院實施才有說服力啦

on call不給錢就不算加班啦~~~~哪有上那麼多班!!?

不敢漲健保費都沒用

：再囉嗦就安排下次大選完後會議再討論

跑就跑哪有差

最近聽到高中生抱怨沒考上牙醫，只考上醫學系,覺得很丟臉和失望的言論官員真的很爛，把台灣醫學搞成這樣？！把升等綁科技部計畫刪掉，應該會留住一些人？！

要賣命才能升等，那就乾脆不要升等，自己當老闆

現在升等除了賣命還要賣臉面 臉面不夠 賤命一條罷了

明明很簡單~不想認真做的時候就把他攪渾罷了....住院醫師已經適用勞基法對加班值班費免稅好處理主治醫師免打卡難以界定上下班時間去吵加班免稅是搞笑主治醫師就改成執行業務所得就好也符合實際情況 工作必要的支出如聽診器書本醫師服...等還可以列舉扣除既合法又符合實際運作 石崇良念過法律不會不懂啦....

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