本表整理出從 99 年到 110 年，採計五科的排名，以 99 年名次為主做排序。
期間有許多科系小改系名，會放入同一校系中。
若是有分組的，例如清大物理組有再分一般組與天文組，則以最末排名為主。
若有錯誤或是有改採改名改分組的再跟我說一聲。
99 100 101 102 102 104 105 106 107 108 109 110
國立臺灣大學物理學系
[ 1][ 2][ 3][ 3][ 3][ 7][ 7][ 5][ 8][ 10][ 14][ 19]
國立清華大學物理學系光電物理組
[ 14][ 20][ 21][ 23][ 26][ 28][ 33][ 47][ 46][ 39][ 45][ 41]
國立清華大學物理學系物理組
[ 31][ 33][ 34][ 39][ 39][ 35][ 29][ 43][ 39][ 36][ 40][ 42]
國立交通大學電子物理學系光電奈米科學組
[ 32][ 36][ 39][ 46][ 37][ 32][ 39][ 36][ 36][ 30][ 32][ 29]
國立成功大學物理學系光電科學組
[ 37][ 22][ 29][ 34][ 48][ 44][ 42][