[問題類型]:
程式諮詢(我想用R 做某件事情，但是我不知道要怎麼用R 寫出來)
[軟體熟悉度]:
入門(寫過其他程式，只是對語法不熟悉)
[問題敘述]:
各位大神大家好~
http://i.imgur.com/tbduH5L.jpg
這個圖中的每一小坨是植物的位置
是先對每個點的光譜值做kmeans分四群後找出來的
四個頂點是邊界範圍
我想找出散布在圖中每一坨的中心點當作植物中心點
也想知道中心點的位置和個數
Hclust我只放入了x,y座標讓他們分群可是感覺分不太出來QQ結果如圖
http://i.imgur.com/mrC8b6c.jpg
想請問有除了分群以外的方法嗎?
另外想讓R自動決定分群數 有嘗試過elbow method
但是都會出現Error: cannot allocate vector of size 91.4 Gb
不知道自動決定分群數有沒有比較推薦的方法呢
先謝過各位大神了~
現有每個點的資料格式如圖
最左邊是序號 band1~4是光譜值 x,y是x,y座標
http://i.imgur.com/UUPYeCU.jpg
[程式範例]:
plant.cluster <- hclust(dist(remain.plant.add[,1:2]),method = "ward.D2")
png("hclust.png",res = 200,width = 2259,height = 1549)
plot(plant.cluster)
dev.off()
#elbow method
elbow.k <- function(mydata){
dist.obj <- dist(mydata)
hclust.obj <- hclust(dist.obj)
css.obj <- css.hclust(dist.obj,hclust.obj)
elbow.obj <- elbow.batch(css.obj)
k <- elbow.obj$k
return(k)
}
elbow.k(NDVI)
#Error: cannot allocate vector of size 91.4 Gb
[環境敘述]:
R version 3.5.0 (2018-04-23)
Platform: x86_64-w64-mingw32/x64 (64-bit)
Running under: Windows >= 8 x64 (build 9200)
Matrix products: default
locale:
[1] LC_COLLATE=Chinese (Traditional)_Taiwan.950
[2] LC_CTYPE=Chinese (Traditional)_Taiwan.950
[3] LC_MONETARY=Chinese (Traditional)_Taiwan.950
[4] LC_NUMERIC=C
[5] LC_TIME=Chinese (Traditional)_Taiwan.950
attached base packages:
[1] stats graphics grDevices utils datasets methods
[7] base
other attached packages:
[1] ggplot2_2.2.1 NbClust_3.0 rgdal_1.3-3 sp_1.3-1
loaded via a namespace (and not attached):
[1] Rcpp_0.12.18 lattice_0.20-35 crayon_1.3.4
[4] grid_3.5.0 plyr_1.8.4 gtable_0.2.0
[7] scales_1.0.0 pillar_1.3.0 rlang_0.2.2
[10] lazyeval_0.2.1 rstudioapi_0.7 labeling_0.3
[13] tools_3.5.0 munsell_0.5.0 compiler_3.5.0
[16] colorspace_1.3-2 tibble_1.4.2
[關鍵字]:
分群、中心點、位置