Re: [問題] 撈資料

作者: yaowei2010 (yaowei)   2014-08-20 18:28:10
不好意思 讓回復的大大看不懂我的問題 只好重新回一篇
gene_a Chromosome gene_start gene_end | Probe_b Chromosome2 Chr_s Chr_e
A 1 25000 50000 | a1 2 175 200
B X 1000 2000 | a2 4 600 625
C 2 0 800 | a3 1 23575 23600
| a4 X 1010 1035
| a5 1 30000 30025
我想做的是
先對Chromosome是不是在一個→再對位子→假設兩者都相符,收data(不符丟掉
例如上面兩data
probe a3和a5都為chromosome 1 兩位子分別23575~23600及30000~30025
A gene為chromosome 1 ,其位子為25000~50000,上述a5 probe都符合其chromosome
以及gene範圍,歸類到gene A裡的match中
我的想法是兩關,第一關篩選出和gene一樣的chromosome的probe
第二關比較probe的數值要落入gene的位子範圍中(gene_start~gene_end)
大概是這樣> <
以此類推
最後才變成
gene_a match_probe
A a5
B a4
C a1
作者: yaowei2010 (yaowei)   2014-08-20 18:31:00
補充 Probe和gene的數值全都是numeric位子範圍就是指start~end
作者: koai (可笑的自以為...)   2014-08-20 18:31:00
請確認 A gene 有match到 a3 嗎??
作者: yaowei2010 (yaowei)   2014-08-20 18:33:00
阿 沒有@@" 眼殘惹那大大得應該是對的 謝謝指正與指教!!文已修正

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