薛瑞元出生於嘉義縣，父親是小學教師。他畢業於嘉義高中，之後進入台北醫學院。[4]其
專業科目為婦產科，畢業後先是在台北市仁愛醫院實習，而後返回嘉義開業。[4]當時一次
醫療糾紛促使他返回大學進修，38歲時以一類組榜首成績考取臺灣大學法律系，之後取得律
師執照、法律碩士學位。[3][4]