Re: [問題] cluster雙CPU設定

作者: yqwu (走走)   2015-06-23 21:18:52
非常非常感謝版上各位高手的幫助
試了很久之後發現
很有可能不是子機設定的問題
是程式本身平行化的問題
以至於雖然分配了更多的thread 可是效能卻無法提升
另外想請教一下
我們的 scripts檔是這樣子寫的
echo "#!/bin/sh" >> "$homename"scripts.txt
echo "#PBS -N "$filename"" >> "$homename"scripts.txt
echo "#PBS -e "$filename".err" >> "$homename"scripts.txt
echo "#PBS -o "$filename".txt" >> "$homename"scripts.txt
echo "#PBS -q s2" >> "$homename"scripts.txt
echo "#PBS -l nodes=s2:ppn=12" >> "$homename"scripts.txt
echo "cd "$homename"" >> "$homename"scripts.txt
echo "./intel.exe" >> "$homename"scripts.txt
ppn = 12 的地方是說要分12個thread給程式去運算
可是我發現 若是我讓他ppn = 6
依照我的理解應該是分配六個thread去算
可是執行的結果 他依然是使用12個thread
請問這樣子是正常的嗎?
若是有問題的 那麼是機器設定的問題 還是我丟進去跑的程式的問題呢?
※ 引述《yqwu (走走)》之銘言:
: 標題: [問題] cluster雙CPU設定
: 時間: Thu Jun 18 15:34:11 2015
:
: 想要請教一下
: 之前舊的實驗室cluster的子機 本來都是用六核心單CPU
:
: 最近買了新的子機 是兩個六核心的CPU
: 可是安裝完成之後 跑起來的效能和單CPU的一樣
:
: 想請教一下
: cluster雙CPU有需要做甚麼特別的設定
: 才能順利用雙CPU做平行計算呢
:
: 我們是使用openmp的平行化方式
:
: 謝謝
:
:
:
作者: lspci (awk sed echo)   2015-06-24 20:34:00
正常。因為ppn不是幾個thread的意思。thread的控制在環境變數
作者: yqwu (走走)   2015-06-25 17:13:00
那請問要怎麼設定分配給JOB幾個thread啊除了環境變數 有其他的關鍵字嗎 想去查察看怎麼做
作者: lspci (awk sed echo)   2015-06-25 23:03:00
環境變數都設好 剩下的就是你要解的問題跟程式怎麼寫了程式邏輯或演算法問題 這個版就幫不了你了

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