有人質疑教育部違反政府資訊公開法，所以程序有瑕疵、違法。
雖然相關資訊能公開當然最好，但平心而論微調課綱時沒有公開並沒有違法（未見法規
規範微調課綱時應公開相關資訊。）
常見論者以台北高等行政法院103年度訴字第1627號判決指摘教育部已違法云云，
事實上，
1.該判決沒有審理課綱微調程序是否違法。
2.該判決也沒有審理課綱微調程序中教育部是否有適時的公開資訊。
3.該判決僅有審理微調課綱公布後，
台權會向教育部申請公開相關資訊遭駁回的行政處分是否適法。
微調課綱程序在微調課綱公布後就完結了。
台權會在微調課綱公布後向教育部申請政府公開而教育部駁回其申請，此是另一新的程序，
新的申請資訊公開程序與微調課綱程序毫無關係。
課綱訂定流程事實上並沒有任何的法令規範，教育部歷來皆認定課綱之性質為行政規則，
由教育部依高級中學法第8條第2項，自行公布施行。
所以實際上沒有什麼機會違反程序法則（因為根本沒有程序規則。）
下面整理了一下這次的流程跟相關法令，供參。
高中微調課綱訂定流程：
制定機關：教育部
法律依據：高級中學法第8條第2項：「第六條各類高級中學之課程標準或綱要及設備標準
，由中央主管教育行政機關定之。」
制定流程：
1.研發階段：國家教育研究院（下稱國教院）
法律依據：國家教育研究院組織法第2條第4款：「本院掌理下列事項：四、課程、教學
、教材與教科書、教育指標與學力指標、教育測驗與評量工具及其他教育方
法之研究發展。」
2.審議階段：十二年國民基本教育課程審議會（下稱課審會）
審議方式：高中分組審議會