八月六日，張家祝在救災的同時，還要為自由經濟示範區特別條例草案到立法院經濟委員會備詢。張家祝枯坐三十分鐘後，因為立委人數不足而流會。
當輿論聚焦災情，
「上面」急著偷渡自經區案
知情人士指出，六日晚間，張家祝忽然又接到國民黨立委黃昭順的電話，黃昭順告訴張家祝，「上面」要審自經區案。
據轉述，張家祝很納悶，因為才剛協調過，在高雄氣爆完成救災之前，自經區案明明不急，而且六日才流會，立法院經濟委員會怎麼七日又要再開一次會？而黃昭順則意有所指，表示是江宜樺和費鴻泰的意思，她只好再開一次會。
對此，黃昭順接受本刊查證時表示，氣爆那幾天，她天天都有跟張家祝通電話，所以不確定那天跟張說了什麼，但張很尊重立法院的想法，大家各司其所，「我沒有受到壓力，完全按照正常節奏、正常協商結果處理。」
知情人士指出，張家祝如果不去立法院，會被在野黨罵缺席；但他最後去了，卻被罵不是人、冷血部長、頭七部長，還被陳其邁追出來罵。個人榮辱事小，但政務遲遲無法開展，於是張家祝終於覺得不如歸去。
值得玩味的是，費鴻泰事後說，他看張家祝非常生氣離開立法院，希望安撫他，整個下午都在找他，還透過行政院長辦公室找人，卻都找不到，沒想到下午就傳出請辭消息。
為了請辭，張家祝擬了二份稿子，一份是給行政院長江宜樺的正式辭呈，一份是給新聞界的請辭聲明。
據瞭解，在正式辭呈上，張家祝批評「不斷受到在野黨極盡施壓、抹黑、羞辱之能事」，但真正的重點是，他對「本黨（國民黨）立院黨團卻如同散沙，幾無奧援，令人心寒」。
在給新聞界的請辭聲明上，則以「有些政治人物心中只有選舉和立場，並沒有真正關心災民和復建，甚感痛心！」一語帶過，掩飾了國民黨的問題。
張家祝的請辭，驚動了馬英九和江宜樺，強力慰留張家祝的任務，就落在行政院副院長毛治國頭上。
毛治國是張家祝多年好友，兩人都被歸為政壇「交通幫」，但毛治國去按張家祝家電鈴時，在許多電視台記者「見證」下，卻找不到張家祝。以毛張二人的交情，只能說這對好朋友演這一齣實在有「默契」。
請辭動作改變政院態度，
一封價值十六億元的辭職信
不過，張家祝的請辭卻改變了行政院的態度。原本行政院對高雄市十九億元的重建預算斤斤計較，九日就變成行政院秘書長李四川在高雄宣布，「江內閣無條件支持十六億元」。
張家祝「辭官記」，活靈活現呈現了政客玩弄政治鬥爭的醜陋面，至於國計民生，多數時候只是政治人物口中的一個沒有意義的發語詞罷了。