卷積核確立（其實麵包房少女就已經確立）是平行世界後
本次活動就有各種平行世界
分為非主世界跟主世界線
非主世界線三個BE結局
1.法蘭克福戰役後（卷積核後半段）
你指跟爵士鬧翻，爵士直接啟動尼德霍格協議讓所有IOP人形全部關機
你指只能帶AR小隊，忤逆小隊，404，休謨人形去跟找威廉
AR小隊，忤逆小隊，404，休謨人形全軍覆沒，你指被威廉抓起來
最後你指用最後一顆手榴彈跟威廉同歸於盡
9跟45在外圍埋好炸藥，9用最後一口氣直接引爆炸藥
所有帕拉蒂斯的一切都掩埋於黑暗。
主世界線是哈維爾啟動尼德霍格協議讓你指有人力去找威廉算帳。
2.熵减焓增德國統一日
因為格琳娜沒有得E.L.I.D所以跟著你指去德國
也提早跟馬赫蓮碰面，而這條世界線格琳娜成為你指跟安潔中間的聯絡人
所以這條線雙方合作比主世界線更緊密
而這條線RPK沒有成為爵士的內鬼，所以也沒有去臥底到帕拉蒂斯
爵士沒有管道接觸德國內部
老奧貝斯坦提前在統一日發動加冕風暴
你指跟格琳娜雙雙被炸死，在死前雙方坦承面對彼此的心意。
3.卷積核後半段
如果你指進入實驗室的時候碰到的是威廉而不是露尼西亞
那麼你指二話不說就是直接幹掉威廉，但被爵士直接公事公辦逮捕入獄
一年後你指在獄中被以為已經剿滅的帕拉蒂斯給毒死
404小隊跟忤逆小隊還有休謨人形跟特工J會合要去救你指
結果發現奈樂因為爵士給她遺跡資料後直接變成新任的威廉
涅托也強化了。最後還發現"月亮"阿瑪瑞絲接受了奈樂的改造變成最強人形
404小隊跟忤逆小隊還有休謨人形跟特工J直接全滅。