<背景>
到了22世紀以後 開始進行地球軌道開發計劃
在拉格朗日點建立起人造衛星基地、Land 1與Land 2的巨大殖民地作為地球的移民之用
從此地球人開始了移居。
在這些3座殖民地附近有作為資材調度的小行星群「vesta」被稱為"Isis星團"，
此後持續數十年之間繁榮。
可是，在Land 2突然發生生化危機，居民出現大量的犧牲而呈現毀滅的的狀態，而生物研
究的シュトルテ博士也失蹤了。同時Isis星團的最高負責人プレシデントファイブ(五大老)中的オレギ、
レデスマ、ウェーバー3人發動政變，放逐同事的トーゴ，並幽閉了タニア議長。
此後3人自稱為bionoid 3將軍，組成bio軍。
這背後有個被稱為bio凱薩的生物存在，策劃著對Land 1的侵佔。
獨自逃跑トーゴ，跟殘存的人們呼籲向bio軍進行徹底抗戰。
發現事態嚴重的地球方，數次派遣調查隊到Land 1。但是，第1次調查隊到達後，就是失
去消息。此後由機械人部隊組成的第2次調查隊到達，繼續主人公ジン所屬第3次調查隊也出發了。當第3次
調查隊的宇宙艇到達時Land 1，宇宙艇被機器兵軍團襲擊……。
ラグランジュポイント