直球回答你的問題：
參考工程會：https://www.pcc.gov.tw/cp.aspx?n=99E24DAAC84279E4
第42點：工程結算驗收證明書作業流程及填報說明中的二.(三)略以...
「結算總價」之計算方式為
「契約金額」加「增加金額」減「減少金額」減「驗收扣款」。
竣工書圖上的結算金額只能稱作「契約金額」加「增加金額」減「減少金額」的部分，
所以「結算總價」應扣除驗收扣款，於文有據。
※ 引述《kiba ( )》之銘言：
: 依據中央政府各機關工程管理費支用要點
: 工程管理費以各該工程之結算總價為計算標準。但不包括補償費、購
: 地費、遷移費、水電外線補助費、營業稅、規費、法律費、承包商辦
: 理工程之各項利息、保險費及規劃設計監造酬金等。
: 所以通常計算會結算價扣掉保險&稅捐再乘相關比率
: 那請問 驗收扣款需要也扣掉嗎 ?
: 現在假如我結算明細表上是100萬
: 驗收證明書上因為有扣款 所以變95萬
: 要用哪個去計算管理費 ?
: 現在會計單位換算認知不同 多花了85元 硬是要我拿掉一筆 囧
: 早知道不要花那麼接近了 XD

好喔 感謝課長 XD不會不會 我們不認識 XD

想請益 因為和以往辦案經驗不同 我遇到的減少扣款是工程項目結算實作數量減少的 扣款廠商另繳或於工程款扣回雖然在結算扣回 但是由秘書室另外開立收據 就契約金額是是和扣款時無涉的 這樣和上面講的於文有據有點不同而且主計說廠商扣款他們帳要算歲入....

上述扣款有兩部分，驗收扣款及違約金，違約金才有廠商另繳及工程款扣回的情況「結算總價」為「契約金額」加「增加金額」減「減少金額」減「驗收扣款」。

是的 所以我這案例也是有違約金罰款 但就沒算在結算價中 故我也沒另外再敘述